Par définition, l'hypospadias réfère à une "anomalie", une "malformation", un "désordre" de dévellopement du canal urinaire.

Les conséquences sont d'abord urinaires. En fonction de la position de l'ouverture du "méat urétral", l'urine sera projetée mais déviée plus ou moins vers le bas, entraînant des difficultés à contrôler le jet d'urine. Ces dernières sont relatives et leur ampleur varie en proportion de la situation particulière de l'hypospadias.

Dans les formes les plus "proximales" (c-à-d, les plus éloignées du "lieu commun" où s'ouvre l'urètre, c'est à dire au bout du gland), la condition oblige la personne à s'asseoir ou bien à s'accroupir pour uriner.
Cependant, dans les formes les plus "distales" (proches du méat "final"), l'hypospadias n'entraîne que certaines gênes à diriger correctement le jet vers son point de chute.

Les problèmes urinaires rencontrés dans les diverses formes sont quelquefois très différents les uns des autres (par exemple, outre le grade d'hs rencontré, aussi en fonction de la qualité et du nombre d'opérations). Même si certains paraissent objectivement plus importants, aucun d'entre-eux ne doivent être minimisés lorsqu'ils affectent la qualité de vie subjective des sujets touchés.